期刊简介
本刊积极贯彻“预防为主”的工作方针，突出快、简、新和实用性强的特色，及时准确地向国内外报道传染病疫情及动态。
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首页>疾病监测杂志
- 杂志名称：疾病监测杂志
- 主管单位：中国疾病监测
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-2928/R
- 国内刊号：11-2928/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：荣获2003年《CAJ－CD规范》执行优秀期刊奖期刊收录：知网收录(中), 哥白尼索引(波兰), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
单增李斯特菌EGD-e基因组的密码子使用分析
罗雪莲；王海印；叶长芸
关键词：单增李斯特菌EGD-e, 同义密码子, 对应分析
摘要：目的 以单增李斯特菌EGD-e为研究对象,分析其密码子使用模式及影响因素.方法 利用Codon W在线工具分析单增李斯特菌EGD-e基因组的密码子使用情况;利用对应分析、ENC绘图(Nc-plot)等推测影响单增李斯特菌EGD-e密码子偏性的因素;利用高表达优越密码子分析法确定单增李斯特菌EGD-e基因组的主要偏爱密码子.结果 单增李斯特菌EGD-e基因组中G+C含量仅为37%,偏爱使用以U或A结尾的密码子;对应分析显示第1条向量轴与G+C(R=-0.182,P<0.01)、CAI(R=-0.740,P<0.01)呈显著相关,且与后者的相关程度明显高于前者.结论 单增李斯特菌EGD-e基因组的密码子使用具有一定的偏性;推测基因的表达水平是影响单增李斯特菌EGD-e基因组密码子使用的主要因素.同时,基因组密码子使用偏性还受到碱基组成的影响,而基因长度对密码子的使用偏性影响不大.后确定了UUC、UUA等27个密码子为单增李斯特菌EGD-e的优密码子.这些结果将为进一步研究单增李斯特菌的基因组学提供基础.
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