期刊简介
本刊积极贯彻“预防为主”的工作方针，突出快、简、新和实用性强的特色，及时准确地向国内外报道传染病疫情及动态。
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首页>疾病监测杂志
- 杂志名称：疾病监测杂志
- 主管单位：中国疾病监测
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-2928/R
- 国内刊号：11-2928/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：荣获2003年《CAJ－CD规范》执行优秀期刊奖期刊收录：知网收录(中), 哥白尼索引(波兰), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征
梁昊；刘红莹；尤元海；顾一心；张艾煜；王敏；何利华；孟凡亮；张建中
关键词：空肠弯曲菌, 基因芯片, 遗传变异
摘要：目的 为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析.方法 根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tilingCustomArrayTM 90K芯片,设计DNA芯片.芯片包含已测序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列.对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点.结果 中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇.基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征.结论 通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测.
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